Techniques:
Rinnegan : le plus puissant des dôjutsus: nous savons déjà qu'il permet d'utiliser toutes les affinités et d'utiliser la télépathie sur l'adversaire comme pour se connecter mentalement à un allié. Chacun de ses corps partagent la même vision et la même force grâce au Rinnegan.
Futon-Reppuuken (Cyclone dévastateur) : produit une puissante rafale de vent.
Kuchiyose no jutsu (technique d'invocation) : Il invoque soit une langouste géante, soit une chimère-caméléon (ces deux invocations ne sont possibles qu'avec le corps du ninja du clan Fuuma), soit une statue pour le rituel d'extraction des bijuus ou encore ses 6 corps dotés du rinnegan. Le caméléon possède une faculté de camouflage et peut se transformer en tout type de créature pour toutes les situations: un cerbère se divisant en plusieurs chiens, un oiseau au bec effilé, un taureau géant... Pein peut également se cacher dans la bouche de cette créature.
Suiton : Suijin Heki
De l'eau vient vous protéger.
Suiton : Bakushoha (Raz de Marée)
L'utilisateur crache énormèment d'eau qui balaya l'ennemi inonde également le terrain.
Suiton : Suiryuudan No Jutsu : (Le Dragon aqueux)
Un dragon d'eau fonce sur l'ennemi.
Suiton Kaihoudan :
L'utilisateur envoie des jets d'eau qui coupe énormément sur l'ennemi
Mizu Bunshin
Clone fait d'eau.
Katon : Gōryuuka no jutsu
Technique consistant à produire des boules de feu au visage démoniaque. En plus de la capacité incendiaire, comme toute autre technique Katon, cette technique semble avoir un pouvoir destructeur intense puisqu'elle passe facilement au travers du plafond particulièrement épais qui séparait Sasuke et Itachi lors de leur affrontement.
Doton, Doryuuheki" (le mur de boue)
Jutsu de protection. En crachant de la boue par la bouche se crée une immense barrière de terre verticale
Doryūdan : Le souffle du Dragon de Terre
La gueule d'un dragon apparait et envoie des projectiles.
Les 6 corps de Pein
Pein peut invoquer 6 corps dotés du même champ de vision et du Rinnengan.
- Spoiler:
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Raiton daishinso no jutsu: (laser électrique)
A l'aide de sont chakra l'utilisateur envoi une décharge sur son ennemi.
Raiton Kaiten Souda no jutsu (boule de foudre)
A l'aide du chakra, l'utilisateur fabrique une boule de foudre qu'il peut diriger par la pensée, elle se détruit au moindre choc.
Raijin no Ken (épée du Dieu de la foudre)
Creé une épée de foudre
Ame no jutsu
Pein peut provoqué la pluie sur un grand périmètre et grâce à sa il peut repérer ses ennemis.
Suiton Mizoppa
Pein crache un puissant souffle aqueux.